Savijoen maatalouspilotin jatkohanke toteutettiin Savijoen valuma-alueella kymmenen tilan kanssa MMM:n rahoituksella v. 2005–2006. Lounais-Suomen ympäristökeskuksen johtamassa hankkeessa keskityttiin lannoitukseen ja maan laatuun liittyviin kysymyksiin, joissa yhdistyvät viljelyn ja ympäristön yhteiset hyödyt.

Hankkeessa määritettiin jokaisen tilan kahdelta peltolohkolta maan nitraattityppipitoisuuksia eri vuodenaikoina ja eri tavalla viljellyillä pelloilla sekä verrattiin pikamenetelmällä (Typpilaukku) saatuja tuloksia laboratoriossa saatuihin tuloksiin. Erityisen kiinnostuksen kohteena oli typen määrä keväällä ennen kylvöä, sillä typpilannoituksen tarkentamista peltokasveilla on esitetty yhdeksi uudeksi ympäristötuen (v. 2007–2013) lisätoimenpiteeksi. Hankkeessa mitattiin kasvustojen lehtivihreäpitoisuuksia ja pohdittiin mittausten merkitystä muun muassa typen lisälannoitustarpeen määrittämisessä.

Ympäristötukeen on ehdotettu myös ravinnetaseiden laskentaa, joka oli yksi hankkeen painopisteistä. Varsinaisen laskennan lisäksi selvitettiin typpi- ja fosforitaseiden yhteyttä eri kasvutekijöihin.

Hankkeessa kokeiltiin tilakohtaisen peltomaan laatutestin kuoppahavainto-osuutta, jossa maasta havainnoidaan ruokamultakerroksen ja pohjamaan rakennetta. Lisäksi kokeiltiin myös testin täydentäviä osia, joihin kuuluu lierohavainnointi, pinta- ja pohjamaan vedenjohtavuus sekä maahengityksen mittaaminen.

Hankkeen yhteydessä koottiin myös kooste alueella tehdyistä ympäristönhoitoa ja -suojelua koskevista selvityksistä, suunnitelmista ja tietolähteistä.