Kansallisella geenivaraohjelmalla uudistetaan aikaisemmat kansalliset kasvi- ja eläingeenivaraohjelmat (MMM 2001, MMM 2004). Geenivaraohjelma kattaa viljelykasvien, kotieläinten, metsäpuiden ja kalojen geenivarat. Geenivaraohjelma on laadittu maa- ja metsätalousministeriön ja Luonnonvarakeskuksen yhteistyönä.

Geenivaraohjelma ohjaa geenivarojen säilytystä, suojelua ja kestävää käyttöä koskevaa toimintaa. Kansallisen geenivaraohjelman laadinnassa toimintaympäristön muutokset ja niitä heijastavat luonnonvarojen suojelua ja kestävää käyttöä koskevat strategiat ja muut linjaukset ovat ohjanneet ohjelman sisältöä ja painopisteitä.

Luonnonvarakeskus (Luke) koordinoi geenivaraohjelman toimeenpanoa. Geenivarojen säilytys on hajautettu useille julkisille ja yksityisille toimijoille, joista Luonnonvarakeskus on tärkein säilyttäjätaho.

MMM:n alainen geenivaraneuvottelukunta toimii maa- ja metsätalousministeriön geenivarojen suojelua ja kestävää käyttöä koskevien asioiden valmistelun asiantuntijaelimenä. Tehtäviin kuuluvat geenivaraohjelmien kehittäminen ja seuranta, strategiset linjaukset ja lakien valmistelu.